Mặc dù tiếng ồn không liên quan đến sự sinh sản của vi khuẩn trong môi trường được kiểm soát, một phòng mổ vốn có thể hoạt động bình thường sẽ không thể vận hành đúng công năng nếu tiếng ồn quá lớn. Các nguồn tiếng ồn có thể lan truyền qua không khí hoặc các vật rắn như tường và tấm vách, thậm chí có thể truyền đi khoảng cách rất xa thông qua các giá đỡ ống dẫn gió liên kết cứng với thiết bị động lực. Việc thiết kế kiểm soát tiếng ồn tuyệt đối không thể đạt được độ hoàn hảo chỉ bằng cách lắp đặt một vài bộ giảm thanh. Các giá trị tiếng ồn cho phép được quy định trong Tiêu chuẩn đã tính đến tình hình quốc gia của Trung Quốc, là mức tiếng ồn tối đa có thể chấp nhận; so với giá trị cho phép ở nước ngoài, các mức này hơi cao hơn một chút. Nếu điều kiện cho phép, nên duy trì tiếng ồn ở mức thấp hơn giá trị được quy định trong Tiêu chuẩn. Giá trị tiếng ồn cho phép được hiểu là giá trị trung bình của tất cả các điểm đo. Tại Thụy Sĩ, mức quy định là 50 dB(A) đối với phòng mổ vô trùng hạng cao và 45 dB(A) đối với phòng mổ vô trùng, trong khi tiêu chuẩn Đức đưa ra mức 45 dB(A) cho cả hai loại phòng.

Thực tiễn trong nước đã chứng minh mức 45 dB(A) là hoàn toàn có thể đạt được; do đó, Quy chuẩn áp dụng ngưỡng ≤50 dB(A) cho hầu hết các loại phòng, đồng thời quy định ngưỡng 52 dB(A) cho phòng mổ cấp I. Cần xử lý khác nhau tùy thuộc vào tình hình thực tế của từng dự án.

Tiếng ồn trong nhà được hiểu là giá trị trung bình của tất cả các điểm đo.